GIS kanserlerinin yaklaşık %80'inde tümör hücrelerinin büyümesinde rolü bulunan c-KIT mutasyonları saptanmaktadır. KIT mutasyonlarının saptanmadığı bazı olgularda ise PDGFRA gen bölgesinde mutasyonlar gözlenmektedir (tüm GIS kanserlerinin %5-7 'sinde). Bu mutasyonların gen içerisinde bulundukları lokalizasyonlar hastaların imatinib (Gleevec) tedavisine yanıt verip vermeyeceğini önceden belirlememizi sağlamaktadır.

c-KIT ve PDGFRA genlerinde yapılan bilimsel çalışmalarda mutasyonların belirli noktalarda yoğunlaştığı gözlenmiştir. c-KIT geninde en sık 11. ekzonda mutasyonlar saptanmış (tüm GIS kanserlerinin %67'si) olup bu olgular tedaviye çok iyi yanıt vermektedir. 2. sıklıkla mutasyonların gözlendiği bölge ise 9. ekzondur (%10). Bu bölgede mutasyon gözlenen olguların standart doz (400mg/gün) yerine yüksek doz (800mg/gün) ilaç kullanımına daha iyi yanıt verdikleri konusunda bilimsel veriler ortaya konmuştur. Daha nadir olmakla birlikte tedaviye yanıt açısından klinik önemi ortaya konduğu için ekzon 13 ve 17 mutasyonları da dikkat çekmiştir.

PDGFRA geninde yapılan araştırmalarda, hastalarda tedaviye yanıt alma açısından özellikle 12. ekzon mutasyonlarının önemli olduğu belirlenmiştir. Ekzon 18 mutasyonları ise klinik açıdan farklılıklar göstermektedir. Bu bölgedeki bazı mutasyonlar imatinib tedavisine yanıt verirken bazı mutasyonlarda aksi durum söz konusudur. Özellikle tüm GIST kanserlerinin %4-5 'nde gözlenen D842V mutasyonu varlığında bu olgularda imatinibe karşı bir direnç gözlenmiştir. Bu tür olgularda tedavi protokolünde diğer ilaçların kullanıması önerilmektedir.

Merkezimizde, GIST tedavi protokollerine yön veren c-KIT ve PDFGRA gen bölgelerinin incelenmesi çalışmaları 2006 yılı içerisinde başlatılmış ve 2007 yılı içerisinde sonuçlandırılmıştır. Bilimsel verilerin ışığında, c-KIT geninde 9, 11, 13 ve 17. ekzonlar ile PDGFRA geninde 12 ve 18. ekzonların incelenebilmesi için set-up çalışmaları gerçekleştirilmiştir. Merkezimiz 2007 yılı Haziran ayından itibaren DNA dizi analizi yöntemi ile bu bölgelerdeki mutasyonları saptayabilmektedir.


c-KIT, PDGFRA ve PDGFRB mutasyonları ile bağlantılı hastalıklar

TEST	MATERYAL	LOKALİZASYON
GC-MS ile organik	5ml idrar örneği	Aminoasit ve organik asit
Piruvat karboksilaz	CC, AFC, CCV, CVS	Doku kültürü
Propionil-koa karboksilaz Propionik asidüri	CC, AFC, CCV, CVS	Doku kültürü
Metilmalonil-koa mutaz Metilmalonik asidüri	CC, AFC, CCV, CVS	Doku kültürü
14C-propionate incorporation Propionik ve metilmalonik asidüri defektleri (B12 metabolizmasında)	CC, AFC, CCV, CVS	Doku kültürü
Metilkrotonil-koa karboksilaz	CC, AFC, CCV	Doku kültürü
HMG-koa liyaz 3-hidroksi 3-metilglutarik asidüri	CC, AFC, CCV	Doku kültürü
Biotinidaz Multipl karboksilaz yetmezliği	2-3ml kan (Heparinli)	Aminoasit ve organik asit
Serbest ve açil karnitinler	1ml kan (Heparinli)	Metabolitler